SD IT Insan Permata Bojonegoro sesuai visi misinya untuk membentuk generasi yang berprestasi dan memastikan anak didiknya akan mendapatkan kualitas pendidikan terbaik maka diadakanlah pembentukan club Qur’an dan club Olimpiade. kegiatan pembinaan olimpiade MIPA dan Qur’an disini diawali dengan pengadaan seleksi siswa yang berbakat dan pretasi dibidangnya. Terkait club olimpiade MIPA  materi yang diajarkan lebih ke arah penyelesaian soal-soal olimpiade dan materi yang biasa diujikan dalam olimpiade, sekaligus sebagai persiapan KN-MIPA dan olimpiade-olimpiade lainnya yang dibimbing oleh Pembina olimpiade yang sudah berpengalaman. Di kelas Club Olimpiade ini para siswa berkesempatan untuk mendengarkan penjelasan dari tentor-tentor yang tentunya berpengalaman di bidang olimpiade matematika dan IPA serta dapat berdiskusi bersama teman-teman lain mengenai pembahasan soal-soal olimpiade MIPA. Jadi, para siswa club tidak merasa sendiri deh selama persiapan untuk mendapatkan medali emas olimpiade MIPA.

Dalam kelas Al-Qur’an Club SD IT Insan Permata mempersiapkan anak-anak yang berminat dan berbakat dalam bidang keagamaan khususnya tahsin dan tahfidz untuk dibina, dididik dan dipersiapkan dalam menghadapi event-event keagamaan berupa lomba Pentas PAI seperi lomba MHQ/MTQ yang berjenjang dari mulai tingkat Kecamatan sampai Nasional. Selain itu kelas ini dapat menjaring siswa untuk mengikuti Siswa berprestasi(teladan) PAi dari mulai tingkat Kecamatan sampai Nasional.